学会毕业无忧,荧光素酶报告系统(Luciferase reporter)...

时间:2023-11-21 10:35:17  热度:0°C

小编之前的文章已经讲解了luciferase reporter系统在筛选干扰素调节基因中的应用,阅读这篇之前也可以先去回顾一下。原理很简单,就是把启动子序列***到Firefly luciferase之前,用感兴趣的启动子去启动Firefly luciferase的表达。如下图,想要研究IFNa或者IFNβ的表达调控,就把IFNa或者IFNβ的启动子***到Firefly luciferase之前,内参就是用TK基因的启动子启动Renillaluciferase的表达。

图1:荧光素酶报告原理(Rachael Kenworthy et al/ 2009/Nucleic Acids Res)

小编今天讲的是怎么用荧光素酶报告系统(Luciferase reporter)研究基因的启动子和转录因子调控。以下面这篇文章为例,便于理解。

背景:已知Transmembrane protein 174 (TMEM174) 是一个Ⅲ型跨膜蛋白,TMEM174在***脏中的高表达,通过促进细胞增殖诱发***癌。这篇文章的目的是研究细胞是怎么在转录水平上调控TMEM174这个基因的表达的。

于是,作者从全血DNA中扩增了TMEM174的启动子和第一个内含子,***到pGL3-basic载体中。想要pGL3-basic载体的私信小编。

图2:pGL3-basic质粒图谱多***区

通过双荧光素酶报告方法检测发现:-2/500到+1bp,-1000到+674,-700到+674和-186到+674的启动子的活性较高,活性最高启动子区域是-186到+674。活性最低的启动子区域是-890到+674和-466到+674。

图3:TMEM174基因启动子构建和双荧光素酶报告基因检测(Fen Hu/ et al/ 2013/ Exp Ther Med)

找到了活性最高的调控TMEM174基因表达的启动子区域,下一步就是找到调控TMEM174基因表达的转录因子,也就是结合TMEM174基因启动子的蛋白。已知CREB和AP-1与细胞增殖有关,于是作者用EMSA实验验证了CREB和AP-1能够结和TMEM174基因的启动子。下图第3泳道用了CREB竞争性探针减弱了CREB和TMEM174启动子的结合,但第5泳道里的AP-1竞争性探针不能抑制AP-1和TMEM174启动子的结合,说明CREB是特异性结合TMEM174启动子,而AP-1是非特异性结合TMEM174启动子。

全文就这点东西,双荧光报告+EMSA,简单粗暴,做完直接毕业,爽歪歪。

图4:CREB和AP-1的结合活性(Fen Hu/ et al/ 2013/Exp Ther Med)

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