实验步骤:
HEK-293T细胞以 4×10∧5个/孔铺于24孔板,37℃培养12~24h。
2/ 当细胞密度达 60~80%时,转染报告质粒pIFN-β-Fluc(250ng)、 内参质粒pTK-Rluc(2-6ng)、目的基因或空载体(250ng)。阳性对照就是转染能够***IFN-β表达的质粒。想要检测目的基因调控哪个通路,就转染对应通路的***质粒,或用对应通路的药物处理过夜(如poly I:C)。每组做3个重复(有时候3个重复其中1个偏差较大,可以做4-5个重复),37℃培养 24 h。
3/ 弃培养基, 用 PBS 清洗细胞3次,吸净残留液体。按照双荧光素酶报告系统检测试剂盒说明书,用80 µL的1×裂解液加入24 孔细胞培养板,4℃水平摇***裂解20 min;取 30 µL 细胞裂解液上清加至 96 孔板,在避光条件下,分别向各孔加入等体积的荧光素酶底物显色液,用多功能酶标仪测定或单管式荧光检测仪。
4/ 读取Fluc信号后,向各孔分别加入等体积的荧光素酶终止液(stop buffer),测定Rluc值。
5/ 通过计算Fluc/Rluc 的比值, 即完成对IFN-β启动子活性的检测。将未处理组的Fluc/Rluc比值设定为1,那么***组的Fluc/Rluc除以未处理组的Fluc/Rluc比值即激活倍数。
想要检测哪个基因的表达水平,就把对应基因的启动子***到FLuc前,用该基因的启动子来启动FLuc的转录。类似的,该方法也适用于病***基因的转录调控研究,即将病***基因组的5 UTR(或其他的启动子元件如甲病***的亚基因组启动子)***至FLuc前。
常见问题:
Rluc信号检测结果overload
原因:A)内参质粒pTK-Rluc转染太多,可减少内参质粒转染量。B)样品或检测试剂加多了,需要同时减少样品量和检测试剂量,因为是1/1/1的关系。
2/ 药物***不起来
原因:HEK-293T细胞不表达对应药物的受体,比如用LPS***无响应,因为HEK-293T细胞不表达TLR4受体(也不表达其他TLRs)。这时候需要同时转染***物对应的受体。HEK-293T可以响应IL-1β或TNFα等,做之前最好查一下文献是否对你的药物有响应。
3/ 目的基因转染组的F-Luc信号和R-Luc信号都很低。
原因:目的基因可能抑制基因转录或翻译。需要进行转录抑制检测或蛋白翻译抑制检测。这种情况的前提是转染目的基因组的Fluc和Rluc同时低于对照组。
读到这里别退出,后面也很精彩。
学会这个干扰素双荧光报告/FLuc-IFNβ reporter怎么保命?避免大家一看就会,一做就废,下面开始上案例。
来看一篇文章《基孔肯雅病***编码的nsp2,E2和E1强烈抑制β-干扰素信号通路》,分不高,但是操作简单易上手,适合刚入坑的朋友或者时运不济需要临时保命的老油子。
基孔肯雅病***的基本情况:基孔肯雅热病***(Chikungunya virus,CHIKV)在斯瓦希里语或马孔德语中名为Kun qunwala,表示“弯曲”的意思。CHIKV感染的症状包括关:发烧、肌痛、头痛、皮疹和关节痛等。急性症状可持续 2-3 周,但多发性关节痛可能持续数年。CHIKV最早是1952年在东非被发现的,主要由埃及伊蚊和白纹伊蚊传播的一种甲病***(alphavirus)。在2005-2006年期间,印度洋爆发了多次CHIKV疫情,并蔓延到印度,造成了150多万人感染。该病***通过旅行者进一步传播到欧洲和美国。2007年意大利,2010年在法国报告了欧洲最新的CHIKV流行。近期FDA即将批准的首个CHIKV***就是法国Valneva公司研发的,最初可能主要推荐给美国旅行者使用。CHIKV是一种单股正链RNA病***,有囊膜,基因组长约11/8kbp。CHIKV编码非结构多聚蛋白Nsp1234,然后被切割成单个的nsp1、nsp2、nsp3和nsp4,编码的结构多聚蛋白Capsid-E3-E2-6K-E1也会被capsid、furin和信号肽酶切割成单个的结构蛋白。
这篇文章就是从CHIKV编码的9种蛋白中筛选出来抑制干扰素通路的蛋白。把CHIKV编码的几个基因构出来质粒,然后分别用MDA5/RIG-I-MAVS-TBK1-IKK-IRF3通路上的质粒去***。非常简单,整篇文章就下面几张图,没什么好讲的。
如果你有干扰素或NF-κB通路的质粒,像小编一样有条件的,可以把RIG-I/MAD5通路、cGAS-STING通路、TNFα通路、TLRs通路都筛一遍,肯定能捞到一些东西的,毕竟鸟屎都能超导,抓把土都和干扰素通路有关系。筛到通路,找个互作的背锅侠,表型、定位和机制整一整,命就保住了。
需要相关通路质粒的私信小编吧。
文章中图1、2、3、4全在这了(Sojung Bae et al/ 2019/J/ Microbiol/ Biotechnol)
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